Послевоенные годы.
Вольфсбург медленно, но устойчиво прогрессировал в последующие сезоны. Они выиграли несколько любительских первенств, но были неспособны продвинутся вперёд в плей-офф на повышение, пока наконец в 1954 году победив со счётом 2:1 Heider SV не пробился в Оберлигу Норд. Тем не менее Вольфсбург боролся за выживание во всех последующих сезонах пока наконец не вылетел в 1959 году. На момент образования первой профессиональной футбольной лиги — Бундеслиги в 1963 году, Вольфсбург играл в Оберлиге Норд (II).
«Вольфсбург» пребывал во втором дивизионе следующую дюжину лет, на тот момент их лучшим достижением было второе место в 1970. Это второе место позволило им бороться в плейофф за выход в Бундеслигу, но в плейофф они выглядели слабо и пробиться в Бундеслигу не смогли. С середины 70-х до начала 90-х Вольфсбург играл в любительской Оберлиге Норд. Последовательные финиши на первом месте в 1991 и 1992 годах, и затем успех в плейофф позволил им выступать в сезоне 1992—1993 во Второй Бундеслиге. Вольфсбург непрерывно добивался определенного успеха в течение всех 90-х. Команда вышла в финал Кубка Германии в 1995 году, где проиграла Мёнхенгладбахской Боруссии со счётом 0:3. Финишировав вторым в сезоне 1996—1997 Вольфсбург пробился в Бундеслигу.
Вопреки прогнозам клуб не вылетел обратно во Вторую Бундеслигу, а наоборот сумел закрепится в середине таблицы Бундеслиги. В сезоне 1998-99 под руководством Вольфганга Вольфа клуб после 33-го тура занимал 5-е место. Последняя игра стала провальной — проиграш Дуйсбургу 1-6 и шестая итоговая строчка. Этот результат позволил осенью 1999 г. впервые засветится в Европе — стартовать в Кубке УЕФА. В первом круге был пройден венгерский Дебрецен (2-0 и 1-2), во втором голандская Рода (0-0 и 1-0). Но в третьем Вольфсбург был дважды бит мадридским Атетико (2-3 и 1-2). Вольфсбург участвовал в Кубке Интертото в 2000, 2001, 2003 и 2004 годах.
Лучшим достижением в Кубке Интертото был финал 2003 года проигранный итальянской Перудже. Сезоны 2005-06 и 2006-07 клуб заканчивал на 15 месте, едва избежав вылета. Перед сезоном 2007—2008 клуб возглавил бывший тренер мюнхенской Баварии Феликс Магат и привел клуб к лучшему результату в истории — пятое место. Второй старт в Кубке УЕФА стал более успешным. Преодолев в первом круге сопротивление бухарестского Рапида 1-1 и 1-0 клуб попал в групповой турнир, где выступил очень удачно. Вольсбург стал победителем группы Е (победы над Херенвеном 5-1, Брагой 3-2, Портсмутом 3-2 и ничья с Миланом 2-2). В 1/16 финала Вольсбург дважды уступил ПСЖ 1-3 и 0-2. В 2009 году довольно неожиданно, впервые в своей истории, клуб стал чемпионом страны. Чемпионство команде Магата обеспечила вторая часть сезона, а также великолепная игра на своём стадионе. Во втором круге со счётом 5-1 была обыграна Бавария. А дуэт форвардов Графите-Джеко побил рекорд бундеслиги по количеству забитых голов.
В сезоне 2008\2009 Вольфсбург впервые в истории стал чемпионом Германии.